Деятельность института направлена на содействие созданию условий повышения безопасности использования и эффективности применения автоматизированных информационных систем в государственном управлении.

Стремительно развивающиеся компьютерные технологии позволяют Государству создавать информационные системы контроля над оборотом товаров любого рынка. Системы позволяют не только оценивать потоки товаров и выявлять негативные факторы по их обороту в том или ином регионе, но и ограничивают возможность реализации контрафактной продукции.

Однако постоянные изменения конъюнктуры рынков не позволяют избежать ситуаций, при которых вновь вводимые изменения в законодательство или в информационные системы, повышающие эффективность их применения в общем плане, ограничивают, а в некоторых случаях, делают невозможным работу определенного круга предпринимателей, или, наоборот, дают возможность использовать введённые изменения для осуществления оборота контрафактной продукции.

Деятельность ВНИИ ГИСУМ по выявлению таких ситуаций основана на постоянном взаимодействии как с организациями участниками товарных и сырьевых рынков, так и с государственными органами, осуществляющими контрольно-надзорные функции, и разработчиками информационных систем.

Такое взаимодействие позволяет в кратчайшие сроки выявлять проблемы в использовании государственных систем и принимать меры по их устранению, а организациям, взаимодействующим с ВНИИ, своевременно получать информацию об изменениях в законодательстве и в функциональности информационных систем, полноценную поддержку и сопровождение в случае возникновения любых проблемных и спорных ситуаций, в том числе, и в части административных правонарушений.